無菌手術室的概念：無菌或層流手術室是采用空氣潔凈技術對微生物污染采取程度不同的控制，達到控制空間環境中空氣潔凈度適于各類手術之要求；并提供適宜的溫、濕度，創造一個潔凈舒適的手術空間環境。亦即是不論外在的空氣條件如何變化，其室內均能保持原先所設定要求的潔凈度、溫濕度及壓力等性能。由于手術室要嚴格控制低細菌數及低麻醉氣體濃度，所以層流超凈裝置的穩定性是層流凈化手術室的重要驗收指標。不同級別的手術室要求也不一樣，
醫院潔凈手術室基本建設標準:
外置保溫防撞隔音板材，保證絕對保溫，防撞隔音達到國際標準；內側防銹彩鋼板經防菌噴涂；走道及手術室均為無縫地板，以維持手術室之無塵無菌狀態。室內恒溫、恒濕、恒壓，每小時換氣600次，空氣潔凈度達99．98％，感染率達到零.
無菌手術室工作原理：
     外部的空氣經過潔凈系統內的初效、中效、高效空氣過濾器層層凈化后，吹入潔凈室，經過潔凈室工作區后，該氣流與塵埃顆粒及細菌一起送至回風口，殺菌消毒后再與補入的新風一起送至進風口，重復剛才的過程。
即：

重復以上過程，便可達到凈化效果。